O documento interno é aquele que é criado a partir de um modelo de tipo de documento dentro do próprio SEI. Somente os documentos internos podem receber a assinatura eletrônica no SEI. Os documentos externos, ao contrário, não podem ser assinados, apenas autenticados.
Para criar um documento interno, fazer o seguinte:
- Entrar no processo desejado onde o documento será criado;
- Clicar no ícone "Incluir Documento"
; - Selecionar o botão
para ver todos os tipos de documentos disponíveis; - Selecionar o tipo de documento desejado, excetuando-se a primeira opção "Externo";
- Preencher as informações do documento, caso necessário;
- Clicar em "Salvar".
Após a confirmação, deverá abrir-se uma nova janela com a ferramenta de edição do documento, de acordo com o modelo escolhido. Caso não se abra uma nova janela e não seja possível editar o documento, verificar se o seu navegador bloqueou o pop-up do SEI.
Desbloqueando ou não os pop-ups , é possível abrir a janela de edição clicando sobre o documento e a seguir no ícone "Editar Conteúdo" 
.
Uma alternativa prática do sistema SEI, é que o ícone “Incluir Documento” também aparece nas ações de outro documento interno dentro do processo.